黑水虻产卵并不直接产在食物中，而是在附近寻找合适的缝隙产卵，这为养殖中黑水虻卵块的收集提供了方便。在华东地区，一年可发生3-5代，世代重叠性明显。在适宜的环境中，35天即可完成一个世代。一对黑水虻可产卵近千粒，从卵到成熟幼虫，水虻个体增长近4000倍。

黑水虻幼虫历期长，并且有明显的预蛹期，能够实现较长时间的活体存储，根据环境条件，时长可达一周到数月。而一般的蝇类幼虫缺乏明显的预蛹期，发育较快，活体贮存较难。